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暮光

swMATH ID: 6103
软件作者: 斯蒂芬妮·谢伊德
描述: 在具有在两种条件下观察到的基因表达数据的典型微阵列设置中,局部错误发现率描述了给定相应的观察得分或p值水平的基因在两种情况下没有差异表达的概率。p值与局部错误发现率的结果曲线提供了对明确差异和明确非差异基因表达之间的模糊地带的洞察力。包twillight包含两个主要函数:函数twillight.pval对给定输入矩阵或表达式集的平均值差异执行双条件测试,并计算基于置换的p值。函数twillight执行随机下坡搜索,以估计局部错误发现率和影响大小分布。该包还提供了用于过滤正确描述空分布的排列的方法。使用过滤排列,可以减少隐藏混杂因素的影响
主页: http://www.bioconductor.org/packages/2.10/bioc/html/twillight.html
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引用于: 8文件

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