暮光 swMATH ID: 6103 软件作者: 斯蒂芬妮·谢伊德 描述: 在具有在两种条件下观察到的基因表达数据的典型微阵列设置中,局部错误发现率描述了给定相应的观察得分或p值水平的基因在两种情况下没有差异表达的概率。p值与局部错误发现率的结果曲线提供了对明确差异和明确非差异基因表达之间的模糊地带的洞察力。包twillight包含两个主要函数:函数twillight.pval对给定输入矩阵或表达式集的平均值差异执行双条件测试,并计算基于置换的p值。函数twillight执行随机下坡搜索,以估计局部错误发现率和影响大小分布。该包还提供了用于过滤正确描述空分布的排列的方法。使用过滤排列,可以减少隐藏混杂因素的影响 主页: http://www.bioconductor.org/packages/2.10/bioc/html/twillight.html 相关软件: 暮光;生物导体;对;混合器;玉米芯;戴维;compdiag工具;vsn(vsn) 引用于: 8文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 置换过滤:大规模基因组数据显著性分析的新概念。 Zbl 1302.92079号斯特凡妮·谢伊德;斯潘,雷纳 2006 全部的 前5名15位作者引用 2 大卫·R·比克尔。 1 阿兰·塞利斯 1 杰克·C·M·德克斯。 1 彼得·加文,霍尔 1 卢祖宏 1 丹·奈特尔顿 1 曲、龙 1 罗宾(Stéphane Robin) 1 谢弗,朱莉安·斯蒂芬妮 1 谢德,斯蒂芬妮 1 斯潘,雷纳 1 孙,肖 1 王奇英 1 谢建明 1 杨新安 5篇连载文章中引用 2 统计传播。理论与方法 1 应用数学与计算 1 生物计量学 1 统计规划与推断杂志 1 伯努利 在5个字段中引用 6 统计学(62-XX) 三 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 组合数学(05-XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 数值分析(65-XX) 按年份列出的引文