APBS公司 swMATH ID: 5766 软件作者: 内森·贝克;J.Andrew McCammon;迈克尔·霍尔斯特 描述: APBS是用于泊松-玻耳兹曼方程(PBE)数值求解的软件包,PBE是描述盐水介质中分子溶质之间静电相互作用的最流行的连续模型之一。连续静电学在生物分子模拟的几个领域发挥着重要作用,包括模拟扩散过程以确定配体-蛋白质和蛋白质-蛋白质结合动力学、生物分子的隐式溶剂分子动力学、,溶剂化和结合能计算,以确定配体-蛋白质和蛋白质平衡结合常数,并有助于合理的药物设计和生物分子滴定研究。 主页: http://www.poissonboltzmann.org 源代码: https://github.com/Electrostatics/electrostatis.github.io 编程语言: Python、Fortran、C 关键词: 科学/工程;物理学;数学;化学;生物信息学 相关软件: MIBPB公司;禁忌;查姆;TABI公司;产品开发B2PQR;PBEQ解决方案;新加坡;TMSmesh公司;DOLFIN公司;AFMPB公司;UHBD公司;FEniCS公司;格鲁马克斯;供应商管理部;德尔菲;PETSc公司;FFTSVD公司;SMPBS公司;DelPhi Web服务器;阿普斯梅姆 引用于: 95文件 全部的 前5名171位作者引用 10 耿伟华 10 谢德轩 8 卢、本佐 7 J.Andrew McCammon 5 Chandrajit L.巴贾杰。 5 迈克尔·霍尔斯特。 5 英金勇 5 赵珊 4 内森·贝克(Nathan A.Baker)。 4 福雷德里克·吉布 4 徐振丽 4 周爱辉 三 埃米尔·阿列克索夫 三 斯蒂芬·邦德。 三 蔡伟 三 杰汉兹·哈米德·乔杜里 三 陈,段 三 陈家辉 三 姜毅 三 杨莹 2 罗伦娜·巴巴。 2 Jaydeep P.巴丹。 2 陈,战 2 程晓林 2 拉斐尔·伊根 2 黄景芳 2 李波 2 李志林 2 刘建国 2 塞巴斯蒂安·洛伊塞尔 2 伊冯·玛代 2 阮Trung Hieu 2 卢克·奥尔森(Luke N.Olson)。 2 中华·乔 2 权、潮余 2 本杰明·斯坦姆 2 童一英 2 王思文 2 魏国伟 2 徐国良 2 徐金超 2 张波 2 周生高 2 周永成 1 伯克·阿克索鲁 1 安德烈·鲍姆凯特纳 1 彼得·本纳 1 阿里,贝斯科克 1 丹尼尔·博奇科夫 1 米雷尔·博西 1 蔡尚荣 1 E.J.卡彭特。 1 尼古拉斯香槟 1 陈俊贤 1 陈龙 1 陈顺川 1 陈燕来 1 陈一良 1 罗奇什努·乔杜里 1 克里斯托弗·库珀。 1 爱德华·F·克劳福德。 1 埃里克·C·赛尔。 1 杰克逊·德彪尔 1 Ken A.Dill。 1 迪克森,J.M。 1 托德·多林斯基。 1 艾德里安·埃尔科克 1 大卫·C·P·埃利斯。 1 冯欣 1 Marcia O·芬利。 1 克里斯托弗·芬内尔。 1 高培元 1 法国盖伊·巴尔马 1 斯科特·格兰迪逊 1 桂生 1 津桥滨田 1 郝雪军 1 罗伯特·C·哈里斯。 1 塔尼亚哈兹拉 1 阿尔斯迪斯·赫尔加多蒂尔 1 亨克曼,理查德 1 Darryl Dallas霍尔姆 1 胡新云 1 加里·胡贝尔(Gary A.Huber)。 1 黄凤南 1 费罗什·雅各布 1 唐纳德·雅各布斯。 1 季丽杰 1 安德烈·胡佛。 1 乔治·埃姆·卡尼亚达基斯 1 维内拉科隆斯卡亚 1 霍罗姆斯基(Boris Nikolaevich) 1 马修·克内普利。 1 罗伯特·克拉斯尼 1 Kweyu,Cleophas M。 1 邦郡权 1 阿鲁姆·李 1 雷,欢 1 李川 1 李洪亮 …还有71位作者 全部的 前5名39篇连载文章中引用 24 计算物理学杂志 7 计算机物理通信 7 基于分子的数学生物学 5 SIAM科学计算杂志 4 计算物理中的通信 三 应用力学与工程中的计算机方法 三 计算与应用数学杂志 三 科学计算杂志 2 计算机与数学及其应用 2 数学生物学通报 2 比特币 2 计算机辅助几何设计 2 数学和计算机建模 2 计算和数学生物物理 1 理性力学和分析档案 1 数学生物学杂志 1 统计物理学杂志 1 分子模拟 1 应用数学与计算 1 SIAM数值分析杂志 1 计算数学杂志 1 应用数学学报。英语系列 1 偏微分方程的数值方法 1 应用科学中的数学模型与方法 1 应用数学建模 1 SIAM应用数学杂志 1 SIAM审查 1 非线性科学杂志 1 计算优化与应用 1 分析方法和应用 1 计算数学进展 1 非线性科学与数值模拟中的通信 1 工程计算 1 非线性分析。真实世界应用程序 1 系统科学与复杂性杂志 1 多尺度建模与仿真 1 数学生物科学与工程 1 欧洲应用和工业数学系列(ESAIM):数学建模和数值分析 1 应用数学与力学进展 全部的 前5名在20个字段中引用 59 数值分析(65-XX) 49 生物学和其他自然科学(92-XX) 36 偏微分方程(35-XX) 32 光学、电磁理论(78-XX) 12 统计力学,物质结构(82-XX) 7 流体力学(76-XX) 4 计算机科学(68至XX) 4 可变形固体力学(74-XX) 2 概率论与随机过程(60-XX) 2 统计学(62-XX) 2 运筹学、数学规划(90-XX) 1 动力系统和遍历理论(37至XX) 1 变分法与最优控制;最优化(49至XX) 1 微分几何(53至XX) 1 代数拓扑(55-XX) 1 粒子和系统力学(70-XX) 1 量子理论(81-XX) 1 相对论和引力理论(83-XX) 1 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学(91-XX) 1 信息与通信理论、电路(94-XX) 按年份列出的引文