阿沃

ARVO:一个FORTRAN软件包,用于计算溶剂可访问表面积和排除体积的重叠球通过解析方程。用于计算蛋白质的溶剂化能、水合作用、药物结合、分子对接等。重要的是要有高效和精确的算法来计算溶剂可及表面积和排除体积。大分子提出了一种基于新的精确分析方法的FORTRAN软件包,用于计算重叠球的体积和表面积。在这个过程中,表面积和体积表示为第二类在封闭区域上的表面积分。利用赤平投影将曲面积分变换为双积分之和,并将其简化为曲线积分。MPI FORTRAN版本也被描述。该软件包对于计算连续渗流模型的渗流概率也是有用的。来源HTTP://CPC.C.Qub. AC.UK/CyrimeSe/


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