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堡垒3

swMATH ID: 42979
软件作者: Wang,J。;李,J。;Yang,B。;谢瑞。;Marquez-Lago,TT;Leier,A。;Hayashida,M。;Akutsu,T.等人。;Zhang,Y。;周,K-C;塞尔克里格,J。;周,T。;宋,J。;利思戈,T
描述: Bastion3:III型分泌效应器的双层集合预测因子。结果:在这项工作中,我们提出了Bastion3,一个两层集合预测因子,用于从蛋白质序列数据中准确识别III型分泌效应器。与现有的使用单一模型且特征较少的方法相比,Bastion3探索了各种类型的特征,根据这些特征训练单个模型,并最终通过集成学习集成这些模型。我们使用一种新的梯度提升机LightGBM训练模型,并通过一种基于新型遗传算法(GA)的两步参数优化策略进一步提高模型的性能。我们的基准测试表明,与常用方法相比,Bastion3的性能要好得多,ACC值为0.959,F值为0.958,MCC值为0917,AUC值为0.0956,全面优于所有其他工具包5.6以上
主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/35/12/2017/5156061
相关软件: mAHT红色;hCKSAAP_网站;iBitter-SCM(比特-SCM);韦卡;UCI-毫升
引用于: 1文件

连载1篇

1 软计算

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