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NetPyNE公司

swMATH ID: 41314
软件作者: 塞西莉亚,罗马罗;费尔南多·阿劳霍(Fernando Araujo Najman);威廉·莱顿(William W.Lytton)。;安东尼奥·罗克(Antonio C.Roque)。;萨尔瓦多杜拉·伯纳尔
描述: NetPyNE实现和Potjans-Diesmann皮层微电路模型的缩放。Potjans-Diesmann皮层微电路模型是最初在NEST中实现的一种广泛使用的模型。在这里,我们使用NetPyNE(NEURON模拟器的高级Python接口)重新实现了模型,并重现了原始出版物的发现。我们还实现了一种用于缩放网络大小的方法,该方法基于现有的网络理论工作,保留了一阶和二阶统计信息。我们的新实现使我们能够使用具有多室形态和多个生物物理真实离子通道的更详细的神经元模型。这为模型开辟了新的研究领域,包括树枝状加工、单个通道参数的影响、与局部场电位的关系以及其他多尺度相互作用的研究。当运行这些CPU密集型详细模拟时,我们使用的缩放方法提供了根据需要增加或减少网络大小的灵活性。最后,NetPyNE使用声明性语言方便修改或扩展模型;优化模型参数;运行高效的大规模并行仿真;并通过内置方法对模型进行分析,包括局部场势计算和信息流测量。
主页: https://arxiv.org/abs/2005.03764
相关软件: 巢穴;蟒蛇;神经元
引用于: 2文件

2篇连载文章中引用

1 神经计算
1 计算神经科学杂志

按年份列出的引文