iCircDA-MF公司 swMATH ID: 40050 软件作者: 杭伟、刘斌 描述: iCircDA-MF:基于矩阵分解识别circRNA-disease关联。循环RNA(circRNAs)是一组新发现的具有闭环结构的非编码RNA,在各种生物过程中发挥着重要作用。识别circRNAs与疾病之间的关联对于探索复杂的疾病机制和促进针对疾病的治疗至关重要。虽然已经提出了几个计算预测因子,但它们的性能仍然有限。在本研究中,提出了一种新的计算方法,称为iCircDA-MF。由于与实验验证的circRNA-disease关联非常有限,根据从疾病语义信息中提取的circRNA相似性和疾病相似性,以及已知的circR-gene、gene-disease和circRNA-disease的关联,计算潜在的circRNA-diseases关联。然后,circRNA-disease相互作用谱由相邻相互作用谱更新,以纠正假阴性关联。最后,对更新的circRNA-disease相互作用谱进行矩阵分解,以预测circRNA-disease关联。在广泛使用的基准数据集上的实验结果表明,iCircDA-MF优于其他最先进的预测因子,能够有效识别新的circRNA-disease关联。 主页: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31197324/ 相关软件: CircR2疾病;达奇;XGBoost公司;细胞景观;星基;NBI公司;剂量;MOEA/D公司;BioSeq分析;国际MRM;i4mC鼠标;XG-PseU公司;DNA4mC-LIP公司;4mC红色;靶向抗Angio;DeepTorrent深激流;ACP红色;型号_4mc;github;国际BLP 引用于: 3文件 全部的 前5名12位作者引用 2 雷秀娟 1 曹仁智 1 戴、蔡 1 丁慧 1 法尔瓦·哈桑 1 基尔·希佩 1 卡桑德拉·亨特 1 汗、里达·萨瓦尔 1 潘毅 1 宋晓明 1 吴方祥 1 哈桑·祖勒菲卡尔 2篇连载文章中引用 2 信息科学 1 数学生物科学与工程 在4个字段中引用 三 计算机科学(68至XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 统计学(62-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 按年份列出的引文