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Meta-iPVP公司

swMATH编号: 40049
软件作者: Phasit Charoenkwan,Chanin Nantasenamat,Md.Mehedi Hasan,Watshara Shoombuatong
描述: Meta iPVP:一种基于序列的元预测因子,用于使用有效的特征表示改进噬菌体病毒粒子蛋白的预测。噬菌体病毒蛋白(PVP)穿透宿主细胞膜,最终导致细胞破裂,从而释放出复制的噬菌体。因此,准确识别PVP是提高我们对PVP生物学功能和机制的理解的关键一步。因此,需要开发一种能够快速准确识别PVP的计算方法。为了解决这个问题,我们提出了一种新的基于序列的meta-predictor,它使用概率信息(本文称为meta-iPVP)来准确识别PVP。特别是,利用七种特征编码,利用高效的特征表示方法从四种机器学习(ML)算法中生成有区别的概率特征。据我们所知,Meta-iPVP是第一种基于元的PVP预测方法。独立测试结果表明,Meta-iPVP能够区分PVP和非PVP之间的重要特征,并达到最佳精度,MCC分别为0.817和0.642,对应于6-10
主页: https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10822-020-00323-z号
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