NTAP公司

NTAP:用于灵活拼接阵列芯片芯片数据分析。摘要:NTAP的设计目的是分析由灵活的拼接阵列平台产生的芯片数据,并完成各种模式识别任务,特别是对表观遗传学研究有用。NTAP的模块化设计使得数据处理具有高度的可定制性。用户可以使用NTAP执行灵活拼接阵列数据分析的全过程,也可以选择NTAP中的后处理模块来分析其他平台生成的预处理表观遗传数据。NTAP的输出可以保存在标准的GFF格式文件中,并在GBrowse中可视化。可用性和实现:NTAP的源代码可以在http://ntap.cbi.pku.edu.cn/。它是用Perl和R实现的,可以在Linux、Mac和Windows平台上使用。

zbMATH中的参考文献(参考文献2条)

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  1. 贝拉德,卡罗琳;马丁·马格涅特,玛丽·劳尔;布鲁诺,维罗尼克;奥堡,塞巴斯蒂安;Robin,Stéphane:平铺阵列的无监督分类:芯片芯片和转录组(2011)
  2. 何坤;李学勇;周俊丽;邓兴旺;赵洪宇;罗静初:NTAP:用于灵活拼接阵列芯片芯片数据分析(2009)ioport公司