千帕x3 swMATH ID: 38618 软件作者： Alberto Pessia，朱卡·科兰德 描述： Kpax3：大型序列数据集的贝叶斯双聚类。动机：估计隐藏的种群结构是许多遗传学研究中的一个重要步骤。通常，目标还在于确定给定数据分区的样本组之间的哪些序列位置是最有区别的。自动发现数据中存在的有趣模式有助于生成新的生物学假设。结果：我们引入了Kpax3，一种用于双聚类多序列比对的贝叶斯方法。通过对模型参数使用信息丰富的先验分布，以监督的方式确定各个场地的影响。我们的推理方法使用split-merge和Gibbs采样器类型MCMC算法的实现来遍历样本和变量分区的联合后验。我们使用一个大型轮状病毒序列数据集来证明Kpax3能够生成关于病毒蛋白不同选择压力的重要生物学假设。可用性和实现：Kpax3作为Julia包实现，并在MIT许可下发布。源代码和文档位于：https://github.com/albertopessia/Kpax3.jl。 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/12/2132/4841711 源代码： https://github.com/albertopessia/Kpax3.jl 依赖项： 朱莉娅 相关软件： 风扇;贝叶斯派;Matlab公司;张量流量.jl;动态链接库;多元统计.jl;图像项目几何.jl;最近邻居.jl;PRMLT公司;AlexNet公司;金属头.jsl;LightNLP.jl公司;BAMSE公司;毛茸茸的;灵沃;pyG群集;Gmm流量.jl;经验SN;LIBSVM.jl银行;英国标准协会 引用于： 1文件 全部的 前5名6位作者引用 1 萨尔瓦多科莫 1 高、开封 1 泽南·霍 1 梅，刚 1 弗朗西斯科·皮夏利 1 屠敬之 连载1篇 1 计算机科学评论 在1个字段中引用 1 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文