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XG-PseU公司

swMATH ID: 37447
软件作者: 刘凯。;Chen,W。;Lin,H。
描述: XG-PseU:一种基于eXtreme梯度增强的识别假尿苷位点的方法。假尿苷(Ψ)是最常见的转录后修饰物之一,参与一系列生物过程。因此,有效检测假尿苷位点对于揭示其在生物过程中的功能非常重要。虽然已经提出了以单基分辨率识别Ψ位的实验技术,但它们仍然是劳动密集型和昂贵的。最近,为了填补实验方法的空白,提出了识别Ψ位的计算方法。然而,他们的表现仍然不令人满意。在本文中,我们提出了一种基于极限梯度提升(xgboost)的方法,称为XG-PseU,该方法基于前向特征选择和增量特征选择方法获得的最佳特征来识别Ψ站点。我们的结果表明,XG-PseU优于或至少补充了现有的鉴定假尿苷位点的方法。最后,XG-PseU的免费在线web服务器建立在http://www.bimol.cn/。我们希望XG-PseU将成为计算识别Ψ位点的有用工具。
主页: https://link.springer.com/article/10.1007/s00438-019-01600-9
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