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乔木3D

swMATH ID: 37014
软件作者: Derek A.Ruth、Edward S.Chen、Leland Ellis
描述: Arbor 3D:一个交互式环境,用于从多个维度检查系统发育树和分类树。本文研究了一种新的技术,用于可视化树和对象,以及与树和对象的交互,这些对象通常用于传递生物数据中的层次关系。受2D树交互质量的激励,我们将平面生命树隐喻应用于虚拟、半沉浸式3D环境。3D环境通过允许用户在单个屏幕中查看整个数据集,扩展了此隐喻的实用性。树的查询是使用3D输入设备实现的。树本身的这种实时查询提供了一种快速的方法,可用于定性分析层次数据。在本文中,我们描述了实现这种环境的底层技术。最后,我们认为树隐喻的效用是表示高维数据集的基础。可用性:Arbor3D(源代码、SGI IRIX 6.4的二进制可执行文件、Perl解析器和Newick数据文件示例)可通过Internet获得(http://xian.tamu.edu/Arbor3D/). Arbor3D可以在SGI工作站屏幕上以“CAVE模拟器”模式显示,也可以在投影工作台上显示为交互式虚拟环境。
主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/16/11/103/216401
相关软件: 树向导;CloseGraph(关闭图形);RadCon公司;TreeDT树;贝叶斯先生;CloSpan公司;加热器;REVEAL公司;路透社;CMAR公司;树基地;图案猎人;PipMaker软件;AVID公司;BLAT(爆炸);KEGG公司;T-咖啡;集群;ClustalW公司;gSpan(量程)
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