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GeSOp公司

swMATH编号: 36888
软件作者: 哥梅斯·维拉,弗朗西斯科;罗德里格斯·巴纳(Rodriguez-Baena),多明戈S。;瓦兹奎兹·诺格拉,何塞·路易斯
描述: 基于贪婪策略的大基因网络结构优化。在过去几年里,基因网络已经成为模拟生物过程的最重要工具之一。在其他实用程序中,这些网络直观地显示了基因之间的生物关系。然而,由于当前生成的大量遗传数据,它们的规模已经增长到无法管理的地步。为了解决这个问题,可以使用计算方法,例如基于启发式的方法,通过修剪无关关系来分析和优化基因网络的结构。本文提出了一种新的优化大基因网络结构的方法,称为GeSOp。该方法能够对构成输入网络的不相关关系进行大量剪枝。为此,该方法基于贪婪启发式,以获得最相关的子网络。通过从不同生物体获得的基因网络上的两个实验,测试了该方法的性能。第一个实验表明,GeSOp不仅能够显著减小网络规模,而且能够保持生物信息比率。在第二个实验中,检查了改善网络生物指标的能力。因此,本文的结果表明,GeSOp是优化和改进大基因网络结构的可靠方法。
主页: https://www.hindawi.com/journals/cmmm/2018/9674108/
关键词: 大型基因网络;结构优化
相关软件: 阿拉伯联合酋长国-AP;通用汽车公司;OSG-KINC细胞;采访者
引用于: 1文件

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