池测试R swMATH ID: 36313 软件作者: 安格斯·麦克卢尔(Angus McLure)、本·奥尼尔(Ben O'Neill)、海伦·梅菲尔德(Helen Mayfield)、科琳·刘(Colleen Lau)、布雷迪·麦克弗森(Brady McPherson) 描述: PoolTestR:一个R包,用于估计流行率并使用合并样本进行回归建模。汇集测试(也称为群体测试),即对汇集的样本进行诊断测试,在动物和人类疾病监测中有着广泛的应用。分子异种监测(MX)是一种越来越常见的使用案例,通过捕获和测试大量媒介(例如蚊子)来监测媒介传播的疾病。R包PoolTestR是为了满足日益庞大和复杂的分子异种监测调查的需要而开发的,但可以应用于分析涉及集合测试的任何数据。PoolTestR包括简单灵活的工具,用于估计流行率,并在频率论和贝叶斯框架中为合并数据拟合固定效应和混合效应的广义线性模型。混合效应模型允许用户解释调查(包括MX)中经常使用的分层抽样设计。我们通过将PoolTestR应用于模拟具有分层抽样设计的MX调查的大型合成数据集来演示其效用。 主页: https://arxiv.org/abs/2012.05405 源代码: https://github.com/AngusMcLure/PoolTestR网站 依赖项: 对 关键词: arXiv_状态.CO;arXiv_状态ME;arXiv_统计;统计OT;对;R包;合并样本;分子异种监测;墨西哥;分组测试;混合试验 相关软件: RStan(RStan);bin组;对;斯坦;甾醇 引用于: 0个文档 标准条款 1出版物描述软件 年份 PoolTestR:用合并样本估计流行率和回归建模的R包arXiv公司安格斯·麦克卢尔(Angus McLure)、本·奥尼尔(Ben O'Neill)、海伦·梅菲尔德(Helen Mayfield)、科琳·刘(Colleen Lau)、布雷迪·麦克弗森(Brady McPherson) 2020