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DINAMelt公司

swMATH ID: 36131
软件作者: 尼古拉斯·R·马卡姆;迈克尔·祖克
描述: 用于核酸熔化预测的DINAMelt web服务器。DINAMelt web服务器模拟一个或两个单链核酸在溶液中的熔化。其目的不仅是预测杂交核酸对的熔化温度,而且是预测作为温度函数的整个平衡熔化曲线。这两个分子不需要互补,也不需要两条链的浓度相等。自动考虑不同分子物种之间的竞争。计算不仅考虑了异二聚体,还考虑了两个可能的同二聚体以及每个单链分子的折叠。对于这五种分子物种中的每一种,自由能是通过对每个可能的杂交或折叠态的玻尔兹曼因子求和来计算的。对于用户指定范围内的温度,计算预测了物种摩尔分数以及系综的自由能、焓、熵和热容。使用公布的消光系数和计算出的碱基对概率模拟260nm处的紫外线(UV)吸光度。所有结果均以文本文件形式提供,并提供了物种浓度、热容和紫外线吸收率与温度的关系图。该服务器连接到一个活跃的研究项目,并应随着新理论和软件的开发而发展。服务器URL为http://www.bioinfo.rpi.edu/applications/hybrid/。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1160267/
相关软件: 寡核苷酸阵列;Sfold公司;百万倍;tRNA扫描-SE;UNA折叠;RNA形状;RandPS公司;爆炸;PSI-爆炸;阿文;FORESST公司;Hum-位置;信号-CF;ToMoCoMD-CARDD公司;位置传感器;统计学;全球气候变化评估;RNA丛;GenRGenS公司;法国皇家医学会
引用于: 7文件

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