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TEIRESIAS公司

swMATH ID: 35978
软件作者： Rigoutsos I.，Floratos A。
描述： 生物序列中的组合模式发现：TEIRESIAS算法。动机：在生物序列中发现基序是一个重要的问题。结果：本文提出了一种新的生物序列刚性模式（基序）发现算法。我们的方法本质上是组合的，能够产生出现在至少一个（用户定义的）最少数量的序列中的所有模式，但它通过避免枚举整个模式空间而非常有效。此外，报告的模式是最大的：任何报告的模式都不能变得更具体，并且仍然会出现在输入序列中的相同位置。提出的方法的有效性在一些测试用例上得到了展示，这些测试用例旨在：（i）通过发现以前报告的模式来验证方法；（ii）证明能够自动识别特定于所考虑序列的高度选择性模式。最后，实验分析表明，该算法对输出敏感，即其运行时间与生成的输出大小呈准线性。
主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/14/1/55/267266
相关软件： Pfam公司;BioProspector公司;模因;变压器;ELM公司;Cd命中;4.5条;PROSITE公司;CMAR公司;塞达R;UCI-毫升;PRMLT公司;Clustal X公司;HMMER公司;SWIFT银行代码;BLAT（爆炸）;PMS5系列;BaCelLo公司;伦敦银行支持向量机;前缀跨度
引用于： 9文件
全部的 前5名

27位作者引用

1 穆斯塔法·阿巴斯。
1 萨伊德·阿卜杜达伊姆
1 亚历山大，乔伊
1 罗恩·阿佩尔。
1 哈泽姆·巴希格。
1 尼基尔·班萨尔
1 Panayiotis V.贝诺斯。
1 Chiu，Bill‘元朝’
1 金子，亚伦
1 罗宾·格拉斯
1 顾红红
1 威廉米安娜·哈姆哈利宁
1 埃尔南德斯，大卫·罗梅罗
1 伊蒙·基奥（Eamonn J.Keogh）。
1 莫舍·勒文斯坦
1 Jessica T·林。
1 斯特凡诺·洛纳尔迪
1 马斌
1 肖恩·马霍尼
1 亚历山大·莫雷尔
1 布莱恩·奥唐纳
1 安东尼娅·帕潘德里欧-苏帕波拉
1 约翰·佩尔弗雷内
1 特里·史密斯。
1 宋涛
1 杰弗里·韦伯。
1 张凯忠
全部的 前5名

引用于8个系列

1 新一代计算
1 算法
1 神经网络
1 数据挖掘与知识发现
1 计算生物学和化学
1 离散算法杂志
1 计算机科学中的数学
1 理论生物学杂志

在5个字段中引用

6 计算机科学（68至XX）
4 生物学和其他自然科学（92-XX）
1 概率论与随机过程（60-XX）
1 统计学（62-XX）
1 运筹学、数学规划（90-XX）

按年份列出的引文