ddbRNA swMATH ID: 35749 软件作者： di Bernardo D.、Down T.、Hubbard T。 描述： ddbRNA：检测多重比对中的保守二级结构。动机：结构化非编码RNA（ncRNAs）在细胞中具有非常重要的功能作用。尚未发现所有非编码RNA共有的独特的一般特征。这使得设计能够检测基因组序列中新的非编码RNA的计算工具变得困难。结果：我们设计了一种算法，能够检测成对和多重DNA序列比对中的保守二级结构，计算时间与序列长度的平方成正比。我们实现了成对和三向比对的算法，并在公共数据库获得的ncRNAs上进行了测试。在测试集上，成对算法的特异性大于97 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/19/13/1606/225148 相关软件： 科福尔加;MARNA公司;PSoL公司;项目II;Sfold公司;RNA动力学;RSEACH公司;Pfold（折叠）;CONTRAfold公司;阿拉贡;snoSeeker（搜索引擎）;T-咖啡;百万倍;tRNA扫描SE;RNA形状;法国皇家医学会 引用于： 1文件 3位作者引用 1 埃尔南多·德尔·波蒂略。 1 阿兰·米切尔·达勒姆 1 阿丽亚娜·马查多·利马 连载1篇 1 数学生物学杂志 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文