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swMATH标识: 35656
软件作者: 韩宇,安德鲁S.尤奥,伊娃·格林沃尔德
说明: 转录位点聚类分析仪(CATS):一个基于C++的程序,用于识别聚集的转录因子结合位点。我们已经开发了一个程序,用于转录位点的聚类分析(CATS),它可以识别任何基因组序列中的转录因子结合位点簇。该程序在一个窗口(DNA长度)内搜索DNA结合的一致序列簇。窗口大小和簇大小(给定窗口内一致序列的数量)可以改变。CATS可用于单个或多个转录因子,根据生化和突变分析,或通过比较基因组学推导出一致序列。利用CATS对不同转录因子结合位点进行聚类,可能有助于识别以特定细胞类型或特定发育阶段的方式共同调控的基因。CATS很容易在运行任何windowsnt平台的计算机上安装和使用。可利用性:http://www.healthsciences.columbia.edu/dept/greenwaldlab/links.html
主页: https://academical.oup.com/bioinformatics/article/20/7/1198/245738
相关软件: CIS模块
参考文献: 1个出版物

参考1系列

1 应用统计学年鉴

按年份引用出版物