BAPS 2号

BAPS 2：遗传群体结构分析的增强可能性。基于模拟技术的贝叶斯统计方法最近被证明为遗传群体结构的分析提供了有力的工具。我们以前开发了一个基于分子标记和数据集地理抽样设计的马尔可夫链蒙特卡罗（MCMC）算法来描述遗传差异群体。然而，对于大规模数据集，这种算法可能会陷入参数空间的局部极大值。因此，我们修改了我们早期的算法以支持多个并行MCMC链，与早期版本的算法相比，增强的特性使估计速度更快、更可靠。我们还考虑了一个层次树表示，从中可以提取贝叶斯模型平均结构估计。该算法在一个具有用户友好界面和内置图形的计算机程序中实现。通过对模拟数据和广泛的人类分子数据集的分析，说明了增强的特征。可用性：免费访问http://www.rni.helsinki.fi/jic/bapspage.html

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zbMATH参考文献（参考 7篇文章 参考）

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  1. Mazet，Olivier；Rodríguez，Willy；Chikhi，Lounès:使用单个个体的遗传数据进行人口统计学推断：从种群结构中分离种群规模变化（2015）
  2. Nasiri，Jaber；Naghavi，Mohammad Reza；Kayvanjoo，Amir Hossein；Nasiri，Mojtaba；Ebrahimi，Mansour：利用SSR分子数据对一些有监督和无监督的基因型鉴别算法的精度评估（2015年）
  3. Bingham，Ella；Mannila，Heikki:Hardy-Weinberg平衡在混合模型中的复杂性控制（2009）
  4. Corander，Jukka；Gyllenberg，Mats；Koski，Timo:基于数据随机分区和并行搜索策略的贝叶斯无监督分类框架（2009）ioport公司
  5. Corander，Jukka；Gyllenberg，Mats；Koski，Timo:基于数据随机分区和并行搜索策略的贝叶斯无监督分类框架（2009）
  6. Corander，Jukka；Gyllenberg，Mats；Koski，Timo:用于人口结构贝叶斯识别的随机划分模型和可交换性（2007）
  7. 柯兰德，朱卡；唐静：基于关联分子信息的种群结构贝叶斯分析（2007）