BAPS 2号

BAPS 2:遗传群体结构分析的增强可能性。基于模拟技术的贝叶斯统计方法最近被证明为遗传群体结构的分析提供了有力的工具。我们以前开发了一个基于分子标记和数据集地理抽样设计的马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)算法来描述遗传差异群体。然而,对于大规模数据集,这种算法可能会陷入参数空间的局部极大值。因此,我们修改了我们早期的算法以支持多个并行MCMC链,与早期版本的算法相比,增强的特性使估计速度更快、更可靠。我们还考虑了一个层次树表示,从中可以提取贝叶斯模型平均结构估计。该算法在一个具有用户友好界面和内置图形的计算机程序中实现。通过对模拟数据和广泛的人类分子数据集的分析,说明了增强的特征。可用性:免费访问http://www.rni.helsinki.fi/jic/bapspage.html