BAPS 2(安全带2) swMATH编号: 35649 软件作者: 朱卡·科兰德(Jukka Corander)、帕特里克·沃尔德曼(Patrik Waldmann)、佩卡·马丁宁(Pekka Marttinen)、米科·西兰帕德(Mikko J.Sillanpä) 描述: BAPS 2:增强了遗传群体结构分析的可能性。基于模拟技术的贝叶斯统计方法最近被证明为遗传群体结构分析提供了强有力的工具。我们之前开发了一种马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)算法,用于基于分子标记和数据集地理抽样设计来表征遗传分化群体。然而,对于大规模数据集,此类算法可能会陷入参数空间的局部极大值。因此,我们修改了我们的早期算法,以支持多个并行MCMC链,与早期版本的算法相比,具有增强的功能,能够实现更快、更可靠的估计。我们还考虑了层次树表示,从中可以提取贝叶斯模型平均结构估计。该算法在具有用户友好界面和内置图形的计算机程序中实现。通过对模拟数据和大量人类分子数据集的分析,说明了增强的特征。可用性:免费提供http://www.rni.helsinki.fi/jic/bapspage.html 主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/20/15/2363/233009 相关软件: 结构;iCDI-PseFpt公司;iEzy-药物;iNuc-PhysChem;邻硝基-Tyr;iRSpot-PseDNC公司;Geneland公司;科学Py;弗拉佩;PSMIX公司;哈普洛维;电子BURST 引用于: 6文件 全部的 前5名14位作者引用 3 朱卡·科兰德 2 吉伦伯格,马茨 2 蒂莫·J·T·科斯基。 1 艾拉·宾厄姆 1 卢内斯·奇奇 1 曼苏尔·易卜拉希米 1 阿米尔·侯赛因·卡瓦约 1 海基·曼尼拉 1 奥利维·马泽特 1 穆罕默德·雷扎·纳加维 1 贾伯·纳西里 1 莫伊塔巴·纳西里 1 威利·罗德里格斯 1 唐靖 全部的 前5名6篇连载文章中引用 1 数学生物科学 1 数学生物学通报 1 理论种群生物学 1 计算统计与数据分析 1 数据分析和分类进展。ADAC公司 1 理论生物学杂志 在5个字段中引用 4 统计学(62-XX) 4 生物学和其他自然科学(92-XX) 2 计算机科学(68至XX) 1 数值分析(65-XX) 1 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学(91-XX) 按年份列出的引文