集群重要性

Bioconductor/R包ClusterSignificance:ClusterSignificance包提供了评估降维数据表示中的类簇是否与置换数据有区别的工具。ClusterSignificance包提供了工具来评估降维数据表示中的类簇是否与置换数据有不同的分离。这里的术语“类簇”是指表示数据中已知类的点簇。这对于确定变量的子集(例如特定路径中的基因)是否能够单独将样本分为这些已建立的类别尤其有用。clustersignality通过将所有点投影到一维直线上来实现这一点。然后对聚类分离进行评分,并使用排列方法评估所见分离因偶然性而产生的概率。

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  1. Demidenko,Eugene:下一代(K)-均值算法(2018)