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MVDA公司

swMATH ID: 35562
软件作者: Serra,A.、Fratello,M.、Fortino,V.、Raiconi,G.、Tagliaferri,R.、Greco,D。
说明: MVDA:一种多视图基因组数据集成方法。结果:我们提出了一种多视图方法,将来自不同数据层(视图)的信息集成在每个单视图聚类迭代的结果级别。它通过以后期集成的方式分解成员矩阵来工作。我们在六个多视角癌症数据集上评估了该方法的有效性和性能。在所有病例中,我们发现患者亚类具有统计意义,确定了以前文献中未强调的新亚类。与其他多视图聚类算法相比,我们的方法表现更好,并且与其他现有方法不同,它能够量化单个视图对最终结果的贡献。结论:我们的观察结果表明,在亚型分析中结合先验信息和基因组特征是识别疾病亚组的有效策略。该方法在R中实现,源代码可在线获取http://neuronelab.unisa.it/a-multi-view-genomic-data-integration-methodology/。
主页: https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-015-0680-3
依赖项: R(右)
相关软件: GISTIC2.0标准;fclust公司;JIVE公司;maskmeans公司;复杂热图;卡普塞;ggplot2;R(右)
引用于: 2文件

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2 统计学(62-XX)

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