MARNA公司 swMATH编号： 35539 软件作者： 斯文·西伯特；罗尔夫·巴科芬 描述： MARNA：基于序列结构比较的RNA多重比对和一致性结构预测。结果：我们描述了一种新的RNAs多重比对方法（MARNA），该方法同时考虑了一级和二级结构。它基于RNA的两两序列结构比较。根据这些序列-结构对齐，生成加权对齐边库。权重反映了顺序和结构守恒。对于二级结构缺失的序列，库是通过采样低能构象生成的。然后，这些库被T-Coffee系统处理，这是一种基于一致性的多重对齐方法。此外，我们能够从多重比对中提取一致序列和结构。我们已经成功地在来自Rfam数据库的多个数据集上测试了MARNA。可用性：MARNA可在我们的网页www.bio.inf.uni-jena.de/Software/MARNA/index.html上在线使用 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/21/16/3352/216225 相关软件： 法国皇家医学会;STRAL公司;ClustalW公司;MAFFT公司;T-咖啡;RSEACH公司;iLoc-Euk公司;中心Alifold;TurboFold公司;RN验证;CompaRNA公司;玫瑰;肌肉;拆分树;探针Cons;科福尔加;ddbRNA;PSoL公司;项目II;Sfold公司 引用于： 3文件 全部的 前5名被10位作者引用 1 塞德里克·乔夫 1 埃尔南多·德尔·波蒂略。 1 阿兰·米切尔·达勒姆 1 傅浩跃 1 瓦伦丁·吉侬 1 西尔维·哈默尔 1 阿丽亚娜·马查多·利马 1 阿伊达州瓦朗拉乌阿 1 杨连平 1 张向德 引用于3个系列 1 数学生物学杂志 1 理论计算机科学 1 理论生物学杂志 在2个字段中引用 3 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文