多位置 swMATH编号: 35402 软件作者: 安妮特·霍格伦德、皮埃尔·德内斯、托尔斯滕·布鲁姆、汉斯·沃纳·阿道夫、奥利弗·科尔巴赫 描述: MultiLoc:使用N末端靶向序列、序列基序和氨基酸组成预测蛋白质亚细胞定位。动机:未知蛋白质的功能注释是蛋白质组学的主要目标。一个关键的注释是预测蛋白质的亚细胞定位。已经开发了许多预测技术,通常侧重于单个潜在的生物学方面或预测所有可能的定位的子集。通过捕获和汇集生物相关信息,以及满足提高预测准确性和定位覆盖率的明确需求,在模拟蛋白质分类过程方面迈出了重要一步。结果:我们提出了一种新的基于SVM的亚细胞定位预测方法,该方法集成了N末端靶向序列、氨基酸组成和蛋白质序列基序。通过将我们的方法TargetLoc与现有方法进行比较,我们展示了这种方法如何改进基于N-末端靶向序列的预测。此外,MultiLoc在预测所有主要真核生物亚细胞定位方面的性能大大优于可比方法,并且与专门针对较少定位或针对一种生物的方法相比,显示出更好或可比的结果 主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/22/10/1158/236546 源代码: https://github.com/KohlbacherLab/MultiLoc2 相关软件: 多位置2;位置传感器;iLoc-Euk公司;欧洲公共图书馆;欧盟-mPLoc;工厂-mPLoc;巴塞尔洛;哼-mPLoc;伦敦银行支持向量机;配对ProSVM;iLoc-Virus病毒;爆炸;PSI-爆炸;ESLpred公司;Hum-位置;InterProScan公司;iSNO-PseAAC公司;iRSpot-PseDNC公司;iLoc-Hum公司;Memtype-2L型 引用于: 7文件 全部的 前5名18位作者引用 3 梅,苏玉 1 Vo V.安。 1 米凯尔·博登 1 费比安·巴斯克(Fabian A.Buske)。 1 崔晓文 1 杜俊伟 1 韩国胜 1 李珊 1 斯特凡·马切克 1 贝扎德·莫西里 1 彭彦军 1 邱文英 1 梅迪·萨德吉 1 王明辉 1 于斌 1 于兆敏 1 俞祖国 1 普亚·扎克里 2篇连载文章中引用 6 理论生物学杂志 1 模式识别 在3个字段中引用 7 生物学和其他自然科学(92-XX) 5 计算机科学(68至XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 按年份列出的引文