DiMoVo公司 swMATH编号: 35351 软件作者: 朱莉·贝纳(Julie Bernauer)、兰吉特·普拉萨德·巴哈杜尔(Ranjit Prasad Bahadur)、弗朗西斯·罗迪尔(Francis Rodier)、乔尔·贾宁(Joöl Janin)、安妮·波彭(Anne Poupon) 描述: DiMoVo:一种基于Voronoi细分的方法,用于区分晶体和生物蛋白质-蛋白质相互作用。动机:了解蛋白质的寡聚状态对于理解其功能和机制通常是至关重要的。在蛋白质晶体中,每个蛋白质单体与许多其他单体接触,形成许多小界面和一些较大的界面,如果蛋白质是溶液中的同二聚体,则这些界面具有生物学意义,但如果蛋白质是单体,则不具有生物学意义。将这种“晶体二聚体”与真实的区分开来仍然是一项艰巨的任务。结果:已经证明,使用Voronoi细分方法计算的参数组合可以区分天然和非天然蛋白质-蛋白质复合物的界面。我们在本文中表明,相同的参数突出了生物二聚体和晶体二聚体界面之间的显著差异。在机器学习方法中使用这些参数作为描述符可以准确地分类特定和非特定蛋白质-蛋白质界面。可用性:软件可在http://fifi.ibbmc.u-psud.fr/DiMoVo 主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/24/5/652/203404 相关软件: 引用于: 1文件 3位作者引用 1 弗雷德里克·卡扎尔斯 1 汤姆·德雷福斯 1 查尔斯·H·罗伯特。 0连载引用 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文