配对ProSVM swMATH编号: 35332 软件作者: Mak,M。;郭杰。;孔,S。 描述: 成对ProSVM:基于局部成对轮廓对齐和SVM的蛋白质亚细胞定位。蛋白质的亚细胞位置是重要的功能注释。蛋白质组学研究需要一种有效可靠的亚细胞定位方法。本文介绍了一种新的自动预测蛋白质亚细胞位置的方法——PairProSVM。利用PSI-BLAST构建训练集中所有蛋白质序列的轮廓,并利用两两轮廓对齐分数形成特征向量,用于训练支持向量机分类器。研究发现,即使删除了大部分同源序列,PairProSVM仍优于基于序列比对和氨基酸组成的方法。根据Huang、Li和Gardy等人的蛋白质数据集对PairProSVM进行了评估。这些数据集的总体精确度分别达到75.3%和91.9%,高于或可与序列比对和基于合成的方法获得的精确度相比较 主页: https://ieeexplore.ieee.org/document/4384576 相关软件: 位置传感器;多位置;多位置2;欧洲公共图书馆;欧盟-mPLoc;Gneg-mPLoc公司;工厂-mPLoc;巴塞尔洛;Nuc-ploc(数字);MemLoci公司;iLoc-Euk公司;iLoc-Virus病毒;爆炸;PSI-爆炸;普索特布;伊苏布8;pSLIP接口;PSLpred公司;ESLpred2;Gpos-PLoc公司 引用于: 2文件 4位作者引用 1 梅,苏玉 1 贝扎德·莫西里 1 梅迪·萨德吉 1 普亚·扎克里 连载1篇 2 理论生物学杂志 在2个字段中引用 2 计算机科学(68至XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文