戈里拉 swMATH ID: 35292 软件作者： 伊登，E。；纳文，R。；斯坦菲尔德，I。；Lipson，D。；Z.亚基尼。 描述： GOrilla：用于发现和可视化排序基因列表中丰富的GO术语的工具。结果：GOrilla是一个基于网络的应用程序，它可以在基因排序列表中识别丰富的GO术语，而无需用户提供明确的目标和背景集。这在许多典型情况下尤其有用，其中基因组数据可以自然地表示为基因的排序列表（例如，按表达水平或差异表达）。GOrilla采用灵活的阈值统计方法来发现在排名基因列表顶部显著丰富的GO术语。基于底层分布（称为mHG）的完整理论特征，GOrilla计算了观测到的富集的精确p值，并考虑了阈值多重测试，而无需进行模拟。这使得对数千个基因和数千个GO术语进行严格的统计分析成为可能。浓缩分析的输出可视为一个层次结构，提供了浓缩GO项之间关系的清晰视图。结论：GOrilla是一种高效的GO分析工具，具有独特的功能，是对现有GO富集工具的有益补充。GOrilla相对于其他无阈值丰富工具的独特功能和优势包括严格的统计、快速的运行时间和有效的图形表示。GOrilla可在以下网址公开获取：http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.il 主页： http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.il 相关软件： GOLEM公司;答对 了;GOstat公司;MAVisto公司;TM4公司;FANMOD公司;字符串;iNuc-PhysChem;JASPAR公司;网络格式塔;生物网格;KEGG公司;爆炸2GO;戴维;GO-TermFinder（搜索引擎）;iGA公司;GOTM公司;法蒂戈 引用于： 1文件 2位作者引用 1 帕尼格拉希，普里亚·P。 1 蒂拉莎·拉吉·辛格 连载1篇 1 理论生物学杂志 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文