SNPHarvester公司 swMATH ID: 35289 软件作者： 杨，C。；何，Z。；万，X。；杨琼。；薛，H。；于伟（Yu，W.）。 描述： SNPHarvester：一种基于过滤的方法，用于检测全基因组关联研究中的上位性相互作用。动机：目前有成千上万的单核苷酸多态性（SNP）可用于全基因组关联（GWA）研究。SNP的上位相互作用被认为在确定个体对复杂疾病的易感性方面非常重要。然而，现有的SNP相互作用发现方法要么计算复杂度高，要么在疾病位点边缘效应较弱或不存在时性能较差。因此，需要开发一种有效的方法来在全基因组范围内搜索上位性相互作用。结果：我们提出了一种新的方法SNPHarvester来检测GWA研究中SNP-SNP相互作用。SNPHarvester创建了多条路径，在这些路径中，访问的SNP组往往与疾病存在统计关联，然后获取那些通过统计测试的显著SNP组。它大大减少了SNP的数量。因此，现有的工具可以直接用于检测上位交互作用。通过使用广泛的模拟数据和真实的全基因组数据，我们证明SNPHarvester显著优于其最近的竞争对手，并有望用于实际疾病预后。可利用性：http://bioinformatics.ust.hk/SNPHarvester.html 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/25/4/504/249552 相关软件： epiACO公司；德西克；GWAS目录；MACOED公司；配饰；倍频程；UCI-毫升；威卡；门德尔 引用于： 4文件 全部的 前5名15位作者引用 1 顾飞扬 1 关、博信 1 何增友 1 李嘉涵 1 李润泽 1 李，袁 1 刘晓庆 1 玛丽亚姆·尼库伊·梅尔 1 王、立志 1 吴荣玲 1 杨，肯 1 尹，英 1 赵玉海 1 钟，魏 1 周建宇 3篇连载文章中引用 2 信息科学 1 欧洲运筹学杂志 1 应用统计学年鉴 在4个字段中引用 4 统计学（62-XX） 2 计算机科学（68至XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文