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InterMap3D

swMATH ID: 35272
软件作者: Gouveia-Oliveira,R。;罗克,F.S。;Wernersson,R。;Sicheritz-Ponten,T。;小袋,P.W。;莫尔加德,A。;A.G.佩德森。
描述: InterMap3D:预测和可视化共同进化的蛋白质残基。InterMap3D预测共同进化的蛋白质残基,并将其绘制在3D蛋白质结构上。从单个蛋白质序列开始,InterMap3D自动查找一组同源序列,生成比对,并从蛋白质数据库(PDB)中获取最相似的3D结构。它还可以接受用户生成的对齐。在此基础上,使用三种不同的方法预测共进化残差:互信息行和列加权、互信息/熵和相关性。最后,InterMap3D生成高质量的蛋白质图像,并突出显示预测的共同进化残基。可利用性:http://www.cbs.dtu.dk/services/InterMap3D/
主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/25/15/1963/212361
相关软件: 肌肉;野兽
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