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ReHap公司

swMATH ID: 35233
软件作者: 杰拉奇;佩莱格里尼
描述: ReHap:从霰弹枪测序数据中解决单倍体装配问题的集成系统。单核苷酸多态性(SNP)是最常见的DNA变异形式。染色体上的一组SNP(称为单倍型)在分子生物学和生物医学的广泛应用中具有重要意义。个体染色体(部分/全部)的个性化单倍型是最有希望的基本成分之一,可用于有效的个性化药物(包括诊断和最终治疗)。通过猎枪测序技术的稳步发展,个性化单倍型在技术和经济上都变得可行(例如,参见1000基因组项目-人类基因变异的深度目录)。这一过程中的一个关键算法问题是解决单倍型组装问题(也称为单个单倍型问题),这是使用基于PCR的鸟枪技术产生的大量短片段重建两个单倍型串(父系和母系)的问题。
主页: http://data.cnr.it/data/cnr/pindividual/prodoto/ID83725
相关软件: SpeedHap公司;HapCUT公司;ReFHap公司
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1位作者引用

1 朱塞佩·G·兰西亚。

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