皮罗塞塔 swMATH ID: 35230 软件作者： 乔杜里，S。；Lyskov，S。；J·格雷。 描述： PyRosetta：使用Rosetta实现分子建模算法的基于脚本的界面。PyRosetta是Rosetta分子建模包的一个独立的基于Python的实现，允许用户使用主要的Rosetta采样和评分功能编写自定义结构预测和设计算法。PyRosetta包含与定义Rosetta函数的库的Python绑定，这些函数包括用于访问和操作蛋白质结构、计算能量和运行基于Monte Carlo的模拟的函数。PyRosetta可以用两种方式使用：（i）使用iPython进行交互，（ii）使用Python脚本进行基于脚本的编写。交互模式包含许多帮助功能，非常适合初学者，而脚本模式最适合算法开发。PyRosetta具有与Rosetta类似的计算性能，可以很容易地针对集群应用进行扩展，并已用于演示蛋白质对接、蛋白质折叠、循环建模和设计的算法。可用性：PyRosetta是一个独立软件包，可在http://www.pyrosetta.org根据Rosetta许可证，学术和非营利用户可以免费使用。网站上还提供了演示用法的教程、用户手册和示例脚本。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2828115/ 相关软件： STRIDE（步态） 引用于： 1文件 4位作者引用 1 布鲁诺博尔盖安 1 莱昂纳多·德利马·科雷 1 马尔西奥·多恩 1 马蒂亚斯·克劳斯。 连载1篇 1 计算机与运筹学 在2个字段中引用 1 运筹学、数学编程（90-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文