生物质量管理 swMATH ID: 35162 软件作者： A.纳尔迪。 描述： BioLQM：用于操作和转换生物网络逻辑定性模型的Java工具包。这里我们介绍bioLQM，这是一个新的Java软件工具包，用于转换、修改和分析生物调控网络的逻辑定性模型。BioLQM提供了核心建模操作，作为开发集成建模软件的构建块，或用于组装涉及多个补充工具的异构分析工作流。基于多值逻辑模型的定义，bioLQM实现了导入和导出功能，特别是针对最新的SBML qual exchange格式，以及几种流行工具使用的格式，促进了结合这些工具的工作流设计。模型修改可以定义各种扰动，也可以简化模型，从而简化对大型模型的分析。另一种修改使得能够使用仅限于布尔情况的工具来研究多值模型。最后，bioLQM为开发新型分析工具提供了一个框架。当前版本实现了模型模拟的各种更新模式（特别是同步、异步和随机异步），以及用于识别吸引子的一些静态分析功能。bioLQM软件可以通过命令行和脚本界面集成到分析工作流中。作为一个Java库，它进一步为GINsim和EpiLog交互工具提供核心数据结构，这些工具为细胞和多细胞定性模型提供图形界面和其他分析方法。 主页： http://colomoto.org/biolqm/ 源代码： https://github.com/colomoto/bioLQM 依赖项： Java语言 相关软件： PyBoolNet网络；BoolNet公司；Potassco公司；蟒蛇；品脱；使用乐趣；MaBoSS公司；Cellnoptr公司；对；emba；github；卡斯波；CoLoMoTo公司；J工具 引用于： 1文件 由4位作者引用 1 奥斯蒙德·弗洛巴克 1 马丁·柯伊伯 1 佩德罗·蒙泰罗。 1 约翰·佐博拉斯 连载1篇 1 理论生物学杂志 在2个字段中引用 1 阶、格、有序代数结构（06-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文