卡博姆 swMATH ID: 35129 软件作者: 斯科特·哈泽尔赫斯特(Scott Hazelhurst),苏珊娜·利普塔克(Zsuzsanna Lipták) 描述: 卡博姆!一种新的基于后缀数组的表达式数据聚类算法。结果:我们引入了一种新的字符串相似性过滤器,它有可能消除在表达数据聚类和其他类似任务中进行全面比较的需要。我们的过滤器基于两个字符串之间的多个长精确匹配,附加的约束是这些匹配必须相距足够远。我们给出了使用修改后的后缀数组高效实现的详细信息。我们通过展示我们的新表达式聚类工具wcd-express来证明其效率,该工具使用了这种启发式方法。我们将其与其他当前工具进行了比较,表明它在质量和运行时间方面都非常有竞争力。可用性:源代码和二进制文件在GPL下提供,网址为http://code.google.com/p/wcdest。在Linux和MacOS X上运行。 主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/27/24/3348/304992 相关软件: 消息消息;Readjoiner公司;SHREC公司 引用于: 1文件 2位作者引用 1 迪帕克·加格 1 苏尼塔 连载1篇 1 萨达纳 在1个字段中引用 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文