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NIMROD公司

swMATH ID: 35079
软件作者: 布拉格M、赞扬D、盖吉J、德莱利维奇J、蒂埃鲍特R
描述: NIMROD:在基于常微分方程的随机效应模型中,通过后验的正态近似进行推断的程序。基于常微分方程(ODE)的模型是描述动力系统的广泛工具。在生物医学科学中,每个学科的数据可能很稀疏,很难通过标准非线性回归精确估计各个参数,但通常可以从学科间的变异性中获得信息。这使得使用混合效应模型来估计人口参数变得很自然。虽然最大似然方法是一个有价值的选择,但可识别性问题倾向于贝叶斯方法,该方法可以灵活地结合先验知识。然而,ODE系统和随机效应的存在所带来的困难带来了重大的数值挑战。通过对后验分布进行正态近似,以找到后验分布(MAP)的最大值,可以简化计算。在这里,我们提出了NIMROD程序(基于常微分方程的随机效应模型中的正态近似推理),用于ODE模型中的MAP估计。我们描述了一些具体的实现特征,例如收敛标准和一个近似的留-出交叉验证,以评估模型的拟合质量。在药代动力学模型中,首先,我们评估了该算法的特性,并在仿真中与FOCE和MCMC算法进行了比较。然后,我们说明了NIMROD在HIV感染患者PUZZLE临床试验中对安非那韦药代动力学数据的使用
主页: https://dl.acm.org/doi/abs/10.1016/j.cmpb.2013.04.014
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