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jMetalCpp公司

swMATH ID: 34556
软件作者: López-Camacho,E。;加西亚·戈多伊,M.J。;Nebro,A.J。;Aldana-Montes,J.F。
描述: jMetalCpp:使用C++元启发式框架优化分子对接问题。动机:分子对接是一种基于结构的药物设计和结构分子生物学方法,它试图预测小分子(配体)相对于蛋白质(受体)的位置和方向,以产生具有最小结合能的稳定复合物。为此目的最广泛使用的软件包之一是AutoDock,它结合了三种元启发式技术。我们建议将AutoDock与优化框架jMetalCpp集成,从而提供可用于有效解决对接问题的单目标算法。结果:AutoDock+jMetalCpp的最终组合允许前者的用户轻松使用后者提供的元启发式。通过这种方式,生物学家可以使用比AutoDock中已经提供的更丰富的优化技术。此外,元启发式技术的设计者可以使用分子对接进行案例研究,这可以产生更有效的算法来解决目标问题。可用性和实施:适用于AutoDock的jMetalCpp软件作为C++源代码在http://khaos.uma.es/AutodockjMetal/。
主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/30/3/437/228068
源代码:  https://github.com/jmetal/jmetal网站
相关软件: 蟒蛇;巴利巴斯;MAFFT公司;RAxML公司;卡林;肌肉;群集;SPAdes系列;ClustalW公司;SPEA2公司;MOEA/D公司;;PlatEMO公司;PyTorch公司;数字Py;Autograd公司;PaGMO/PyGMO;派克能源公司;马特普洛特利布;鸭嘴兽
引用于: 2文件

2篇连载文章中引用

1 运筹学国际交易
1 理论生物学杂志

按年份列出的引文