微型剃须刀S swMATH ID: 34361 软件作者: 艾姆德·A.K.、格伦特·M.、韦斯·D.、雷内特·K.、斯珀林·S.R 描述: MicroRazerS:快速对齐小RNA读取。动机:深度测序已成为测定细胞小RNA含量的首选方法。将测序读数映射到参考基因组上是所有进一步分析的基础,即识别和量化。一种常用的方法是Mega BLAST,然后是几个过滤步骤,尽管这项任务速度慢且效率低。此外,目前可用的短阅读比对仪都没有为小RNA定位的特定任务建立自己的功能。结果:我们提出了MicroRazerS,一种优化的工具,用于将小RNA映射到参考基因组。它比Mega BLAST快一个数量级,速度与其他短读映射工具相当。此外,它更灵敏,易于操作和调整。可用性:MicroRazerS是SeqAn C++库的一部分,可以从http://www.seqan.de/projects/MicroRazerS.html。 主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/26/1/123/181328 相关软件: 布瓦;斯特拉;菲奥娜;SeqAn公司;巴特里西亚;Samtools公司 引用于: 1文件 2位作者引用 1 恩里科·西拉古萨 1 大卫·威斯 0连载引用 在1个字段中引用 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文