生物克隆 swMATH ID: 34358 软件作者: Plieskat J.、Rinaldi G.、Brindley P.J.、Jia X.、Potriquet J.、Bethony J.、Mulvenna J。 描述: BioClojure:用于操作生物序列的功能库。动机:BioClojure是一个开源库,用于处理用Clojure语言编写的生物序列数据。BioClojure旨在为生物序列数据的处理提供一个功能框架,该框架为大型数据集的并发和延迟评估提供了简单的机制。结果:BioClojure为一系列生物序列格式提供了解析器和访问器,包括UniProtXML、Genbank XML、FASTA和FASTQ。此外,它还为关键分析程序(包括BLAST、SignalP、TMHMM和InterProScan)提供包装器,并为分析其输出提供解析器。所有接口都利用Clojure的函数风格,强调惰性和可组合性,因此BioClojure和用户定义的函数可以链接到简单的管道中,这些管道是线程安全的,并无缝集成惰性评估。可用性和实现:BioClojure是在Lesser GPL下发布的,源代码可以从GitHub免费获得(https://github.com/s312569/clj-biosequence网站). 主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/30/17/2537/2748169 源代码: https://github.com/s312569/clj-biosequence网站 相关软件: BamTools工具;生物红宝石 引用于: 1文件 2位作者引用 1 丹尼斯·阿列克谢维奇·卡里亚金 1 弗拉基米尔·阿列克桑德罗维奇(Vladimir Aleksandrovich) 连载1篇 1 萨拉托夫斯科戈大学。诺瓦亚·塞里亚。Seriya Matematika、Mekhanika、Informatika 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文