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彗星

swMATH ID: 34271
软件作者: Mark D.M.Leiserson、辛大武、Fabio Vandin、Benjamin J.Raphael
说明: CoMEt:互斥变更的组合。CoMEt改进了Dendrix和Multi-Dendriz算法,在没有先验信息的情况下识别癌症中的专属改变集合。CoMEt使用一种新的用于改变的排他性集合的统计得分和一种MCMC算法来计算在同一排他性集合中观察到成对改变的边际概率。CoMEt在GitHub上作为软件包发布。CoMEt使用的精确测试也可以通过CRAN托管的cometExactTest R包获得。Dendrix++是我们作为TCGA AML项目的一部分应用的CoMEt的初步版本。
主页: http://compbio.cs.brown.edu/projects/comet/
源代码:  https://github.com/raphael-group/comet
关键词: arXiv_q-bio.QM;arXiv_状态.CO;癌症;互斥变更;树状算法;多支线
相关软件: 彗星精确测试
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标准条款

1出版物描述软件 年份
CoMEt:一种识别癌症互斥改变组合的统计方法arXiv公司
Mark D.M.Leiserson、辛大武、Fabio Vandin、Benjamin J.Raphael
2015