恶意诽谤者 swMATH ID: 34217 软件作者： L.M.Mendelowitz、D.C.Schwartz、M.Pop 描述： Maligner：快速有序限制地图对齐器。动机：光学绘图系统通过支架和全球验证或纠正序列组装的比较，发现结构变体并增强基因组序列组装。尽管它很实用，但很少有公开可用的工具来校准光学测绘数据集。结果：在这里，我们提供了一个名为“Maligner”的软件，用于校准单分子限制性内切酶图（Rmaps）和与参考序列相连的电子限制性内切酶图。Maligner提供了两种对齐模式：一种高效、敏感的动态编程实现，可扩展到大型真核生物基因组；另一种基于索引的更快实现，用于查找引用中（而非查询中）具有不匹配位点的对齐。我们将我们的软件与Rmap数据集上其他公开可用的工具进行了比较，结果表明Maligner在可比较的运行时中找到了更正确的比对。最后，我们介绍了M-Score统计用于规范化跨限制映射的对齐分数，并演示了其用于选择高质量对齐的实用性。可用性和实现：Maligner软件是用C编写的 ++ 和可在https://github.com/LeeMendelowitz/maligner网站根据GNU通用公共许可证。 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/32/7/1016/1744175 源代码： https://github.com/LeeMendelowitz/maligner网站 相关软件： 码头；卡努；PBSIM卡；OMBlast公司；深渊；天鹅绒；SPAdes系列；SEQuel公司 引用于： 1文件 5位作者引用 1 巴哈州阿里帕纳希 1 克里斯蒂娜·鲍彻 1 马丁·马格利（Martin D.Muggli）。 1 西蒙·普格利西。 1 莉娜·萨尔梅拉 0连载引用 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文