纳塔利埃Q swMATH ID: 34156 软件作者： El-Kebir，M。；勃兰特，B.W。；赫林加，J。；G.W.克劳。 描述： NatalieQ：用于蛋白质相互作用网络查询的web服务器。背景：为了充分模拟生物系统的复杂行为，需要考虑分子间的相互作用。这些相互作用被各种类型的生物网络捕获，例如代谢、基因调节、信号转导和蛋白质相互作用网络。我们最近开发了natalie，它通过组合优化的高级方法计算高质量的网络对齐。结果：在这里，我们提出了natalieq，这是一个网络服务器，用于使用natalie算法将指定的查询蛋白质相互作用网络与选定的目标网络进行基于拓扑的对齐。通过合并序列和网络级的相似性，我们计算了允许传递功能注释以及预测缺失交互的对齐。我们通过一个涉及Wnt信号通路的生物案例研究来说明natalieq的能力。结论：我们表明，基于拓扑的网络比对可以产生与仅使用序列相似性获得的结果互补的结果。我们还证明了natalieq能够预测假定的相互作用。服务器位于：http://www.ibi.vu.nl/programs/natalieq/。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC398945/ 相关软件： L-格雷尔;麦格纳++;NETAL公司;轮毂对齐;字符串;KEGG公司;IsoRank公司;纳塔利;幽灵;脊柱的 引用于： 1文件 3位作者引用 1 穆罕默德·埃尔·凯比尔 1 雅普·赫林加 1 Klau，Gunnar W。 连载1篇 1 算法 在3个字段中引用 1 组合数学（05-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文