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PINALOG公司

swMATH ID: 34153
软件作者: Hang T.Phan;迈克尔·斯特恩伯格
描述: PINALOG:一种校准蛋白质相互作用网络的新方法——对复杂检测和功能预测的影响。动机:在系统水平上分析蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPIN)在理解生物过程中变得越来越重要。比较不同物种的相互作用体不仅可以更好地了解物种进化,而且有助于检测保守的功能成分和功能预测。方法和结果:这里我们报告了一种PPIN比对方法,称为PINALOG,它结合了来自蛋白质序列、功能和网络拓扑的信息。人类和酵母PPIN的比对揭示了它们之间参与类似生物过程的几个保守子网络,特别是蛋白酶体和转录相关过程。PINALOG在蛋白质复合物预测和功能预测方面的能力已经过测试。与PSI-BLAST在预测黄昏区蛋白质功能方面的比较也表明PINALOG在预测蛋白质功能方面有价值。可用性和实现:PINALOG web服务器可从以下网站免费获得:http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/比那洛。PINALOG程序和相关数据可从web服务器的下载部分获得。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC338015/
相关软件: 化学计量学NETAL公司轮毂对齐DNAGSNCA公司幽灵脊柱的
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