PINALOG公司 swMATH ID: 34153 软件作者: Hang T.Phan;迈克尔·斯特恩伯格 描述: PINALOG:一种校准蛋白质相互作用网络的新方法——对复杂检测和功能预测的影响。动机:在系统水平上分析蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPIN)在理解生物过程中变得越来越重要。比较不同物种的相互作用体不仅可以更好地了解物种进化,而且有助于检测保守的功能成分和功能预测。方法和结果:这里我们报告了一种PPIN比对方法,称为PINALOG,它结合了来自蛋白质序列、功能和网络拓扑的信息。人类和酵母PPIN的比对揭示了它们之间参与类似生物过程的几个保守子网络,特别是蛋白酶体和转录相关过程。PINALOG在蛋白质复合物预测和功能预测方面的能力已经过测试。与PSI-BLAST在预测黄昏区蛋白质功能方面的比较也表明PINALOG在预测蛋白质功能方面有价值。可用性和实现:PINALOG web服务器可从以下网站免费获得:http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/比那洛。PINALOG程序和相关数据可从web服务器的下载部分获得。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC338015/ 相关软件: 化学计量学;NETAL公司;轮毂对齐;DNA;GSNCA公司;幽灵;脊柱的 引用于: 1文件 3位作者引用 1 马蒂亚斯·德梅尔 1 Emmert-Streib,弗兰克 1 石永堂 连载1篇 1 信息科学 在3个字段中引用 1 组合数学(05-XX) 1 计算机科学(68至XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文