NETAL公司 swMATH ID: 34152 软件作者： 奈沙布尔，B。；Khadem，A。；哈希米法尔，S。；阿拉伯，S.S。 描述： NETAL：一种新的基于图形的蛋白质-蛋白质相互作用网络全局对齐方法。结果：我们提出了一种新的蛋白质相互作用网络全局比对算法。它使用一种贪婪的方法，基于从输入网络的生物信息和拓扑信息导出的对齐评分矩阵来寻找最佳的全局网络对齐。NETAL在一些度量方面优于其他全局比对方法，例如边缘正确性、最大公共连接子图和对齐蛋白质之间的公共基因本体术语数。由于NETAL的运行时间远小于其他可用的方法，因此NETAL可以很容易地扩展为多重对齐算法。此外，NETAL在性能上超越了所有其他现有算法，因此NETAL的运行时间短，使我们能够将其作为蛋白质-蛋白质相互作用网络全球比对的第一个服务器来实现。可用性：linux支持的二进制文件可从以下网站免费下载：http://www.bioinf.cs.ipm.ir/software/netal。 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/29/13/1654/185807 相关软件： 凯格;轮毂对齐;幽灵;脊柱的;PathBLAST（路径BLAST）;爆炸;PSI-爆炸;IsoRankN公司;L-格雷尔;纳塔利埃Q;麦格纳++;字符串;IsoRank公司;纳塔利;化学计量学;PINALOG公司;DNA;GSNCA公司 引用于： 3文件 全部的 前5名9位作者引用 1 法里德·阿米尔·吉亚斯旺德 1 马蒂亚斯·德梅尔 1 穆罕默德·埃尔·凯比尔 1 Emmert-Streib，弗兰克 1 雅普·赫林加 1 Klau，Gunnar W。 1 维达·莫门扎德 1 阿巴斯·诺扎里·达里尼 1 石永堂 引用于3个系列 1 信息科学 1 医学中的计算和数学方法 1 算法 在4个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 组合数学（05-XX） 2 运筹学、数学规划（90-XX） 1 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文