军刀

SABER是一个适用于基因组规模数据的程序,它使用“马尔可夫隐马尔可夫模型”来估计本地祖先(Tang H,Coram M,Wang P,Zhu X,Risch NJ。(2006)在混合个体中重建遗传祖先块。我是亨吉奈特。79:1-12.)。这种当地祖先被称为“祖先街区”。与HAPMIX一样,它模拟了祖先的LD;但是它不模拟单倍型结构。输入文件是典型的,包括来自祖先和混合个体的基因型数据,混合个体的全球祖先估计,以及snp的物理地图位置。除了提供本地化的祖先(带有图形输出),SABER还可以用来估计混合后的时间。混合个体遗传祖先块的重建