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DisSetSim(设置偏差模拟)

swMATH ID: 33494
软件作者: 胡毅,赵立,刘忠,居华,石华,徐鹏,等。
描述: DisSetSim:一个用于计算疾病集之间相似性的在线系统。分子之间的功能相似导致相似的表型,例如疾病。因此,从分子诱发疾病的角度来揭示分子的功能是一种有效的方法。然而,缺乏获取成对疾病集(SSDS)相似性得分的工具限制了这种应用。在这里,我们介绍了DisSetSim,这是一个在线系统,可以在本文中解决这个问题。采用五种最先进的方法,包括Resnik、Lin、Wang、PSB和SemFunSim方法,首先测量成对疾病(SSD)的相似性得分。然后采用“逐对平均”(PWBPA)方法通过SSD计算SSDS。该系统用于根据miRNA的诱导疾病集计算其功能相似性。该结果被进一步用于预测潜在的疾病miRNA关系。基于leave-on-out交叉验证的接收机工作特性曲线下的高面积AUC(0.9296)表明,PWBPA方法实现了高真阳性率和低假阳性率。可以从以下位置访问系统http://bio-annotation.cn/DisSetSim。
主页: https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/7822765
相关软件: clusterProfiler(群集探查器);GOSemSim公司;MeSHSim公司;剂量;DaGO乐趣;DOSim公司;蟒蛇;GSimPy公司
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