iScore公司 swMATH编号： 33181 软件作者： Geng，C.，Jung，Y.，Renaud，N.，Honavar，V.，Bonvin，A.M.J.J.，Xue，L.C。 描述： iScore：一种新的基于图核的函数，用于对蛋白质对接模型进行评分。结果：在这里，我们提出了iScore，这是一种对停靠构象进行评分的新方法，它将HADDOCK能量项与使用蛋白质-蛋白质界面的图形表示和进化保守性度量获得的分数相结合。它在两个独立数据集上实现了与最先进的评分功能相竞争或优于的评分性能：（i）对接软件特定模型；（ii）多种对接方法（即对接软件非特定）生成的CAPRI评分集。与CAPRI中的37个评分组相比，iScore在CAPRI评分集（13个目标）中排名最高。结果表明，结合进化、拓扑和能量信息对对接构象进行评分是有用的。这项工作首次成功地证明了图形核与蛋白质界面之间的关系，从而有效区分蛋白质复合体的近天然构象和非天然构象。可用性和实现：iScore代码可从Github免费获得：https://github.com/DeepRank/iScore（DOI:10.5281/zenodo.2630567）。使用的对接模型可从SBGrid获得：https://data.sbgrid.org/dataset/684). 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6956772/ 源代码： https://github.com/DeepRank/iScore 相关软件： pdb工具;码头Q;专业版;数字Py;MD分析;MMTK公司;生物爪哇;ProDy公司;生物蟒蛇;蟒蛇;pdb2sql 引用于： 0个文档