DivNet公司 swMATH ID: 32943 软件作者： 公元前威利斯。；Martin，文学博士。 描述： DivNet：当群落中的分类单元通过生态网络协同出现时，评估多样性的R包。如果你知道群落的确切组成（例如生活在你皮肤上的所有微生物），你可以计算出群落的香农多样性，或者皮肤微生物和猫毛皮微生物之间的Bray-Curtis距离。然而，你只能从实验中观察到皮肤上的一小部分微生物，因此你必须根据数据估计这些多样性指数，理想情况下，你会得到这些多样性指标的置信区间。几乎所有的生态学家都使用“插入式”多样性估计，这是通过将观察到的每个分类单元的相对丰度插入真实多样性的公式中而获得的。这是有问题的，原因有很多，包括可能存在未观察到的分类群，并且由于随机抽样，观察到的相对丰度可能并不完全等于真实的相对丰富度。此外，获得置信区间的典型方法假设所有分类单元都独立运行：如果分类单元a在那里，这就无法告诉您分类单元B是否也可能在那里。DivNet解决了所有这些问题，并为您提供了一个包含所有这些挑战的置信区间。 主页： https://www.biorxiv.org/content/10.1101/305045v1 源代码： https://github.com/adw96/DivNet网站 依赖项： R（右） 相关软件： VGAM公司；DESeq2公司；向上的；美国搜索；brglm2公司；Voom公司；Phyloseq公司；信任；边缘R；ggplot2；生物导体；R（右） 引用于： 1文件 3位作者引用 1 布莱恩·马丁。 1 艾米·威利斯。 1 丹妮拉·维滕（Daniela M.Witten）。 连载1篇 1 应用统计学年鉴 在1个字段中引用 1 统计学（62-XX） 按年份列出的引文