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数据猴子

swMATH ID: 32768
软件作者: 韦弗、S.、S.D.香克、S.J.斯皮尔曼、M.李、S.V.缪斯、S.L.科萨科夫斯基池塘
说明: Datamonkey 2.0:用于描述选择性和其他进化过程的现代Web应用程序。对进化力量如何塑造现存遗传多样性的推断是现代比较序列分析的基石。序列生成的进步和相关方法的统计复杂性的增加,现在允许研究人员从数据中提取更多进化信号,尽管计算成本增加。在这里,我们宣布发布Datamonkey 2.0,这是一个用于分析序列数据中进化签名的Datamonkey网络服务器的完全重新设计版本。为了实现这一目标,我们利用了开源库中的最新发展,这些开源库促进了交互式、健壮和可伸缩的web应用程序开发。Datamonkey 2.0提供了一个精心策划的方法集合,用于查询自然选择印记的编码序列比对,打包为响应式(即可以在平板电脑和移动设备上查看)、完全交互式和支持API的web应用程序。为了补充Datamonkey 2.0,我们还发布了HyPhy Vision,这是一个用于可视化分析结果的JavaScript应用程序。HyPhy Vision也可以与Datamonkey 2.0分开使用,以可视化本地执行的HyPhy分析。Datamonkey 2.0和HyPhy Vision共同展示了科学软件开发如何从通用开源框架中受益。Datamonkey 2.0免费公开,网址为网址:http://www.datamonkey.org,基础代码库可从https://github.com/veg/datamonkey-js。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5850112/
源代码:  https://github.com/veg/datamonkey-js
相关软件: HyPhy公司;蟒蛇;物理学;外部斜坡;TTA猞猁;大坝7;CodonW公司;CodonPhyML(密码物理ML);ntCard(nt卡);敏锐;PAML公司;密码测试;ALF公司;xREI公司;RevTrans公司;MACSE公司;简易代码ML;壁画;标准AIcalc;GCUA公司
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