缩放 swMATH ID: 31864 软件作者： 郝琳、张泽峰、迈克尔·Q·张、马斌、李明 描述： 缩放！数以千计的寡聚物被绘制出来。动机：下一代测序技术每天产生数十亿次短阅读。重测序和个性化医学需要更快的软件将这些深度测序读取映射到参考基因组，以识别SNP或罕见转录物。结果：我们提出了一个框架，说明如何通过间隔种子以最有效的方式进行全灵敏度映射。使用该框架，我们开发了名为ZOOM的软件，该软件能够在一个CPU日内将Illumina/Selexa对人类基因组15倍覆盖率的读取映射到参考人类基因组，允许两个不匹配，并且具有完全的灵敏度。可用性：ZOOM免费提供给非商业用户，网址为http://www.bioinfor.com/zoom 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2732274/#!po=500000 相关软件： 香皂；SHRiMP公司；BWA公司；图案猎人；云爆发（CloudBurst）；YASS公司；烫发；通过；PatMaN公司；RazerS（剃须刀）；HaploReg公司；eSNV检测；Pfam公司；MapSplice（贴图拼接）；斯特雷尔卡；鲑鱼；躯体狙击手；PAL映射器；多质量控制；ReQON公司 引用于： 5文件 全部的 前5名8位作者引用 2 拉维尼亚·埃吉迪 2 乔瓦尼·曼齐尼 1 陈阳军 1 玛尔塔·哥尔达 1 格雷戈里·库切洛夫 1 不，洛朗 1 亚历山大·沃尔夫 1 吴宇佳 2篇连载文章中引用 2 理论计算机科学 1 计算机与系统科学杂志 在4个字段中引用 三 计算机科学（68至XX） 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 组合数学（05-XX） 1 数论（11-XX） 按年份列出的引文