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加热器

swMATH ID: 30527
软件作者: Wang,S.,Zhang,Y.,Dai,W.,Lauter,K.,Kim,M.,Tang,Y。
描述: HEALER:ExAct Logistic rEgResion的同态计算,用于GWAS中的安全罕见疾病变体分析。动机:全基因组关联研究(GWAS)已广泛用于发现基因型和表型之间的关联。人类基因组数据包含有价值但高度敏感的信息。不受保护地披露此类信息可能会危及个人隐私。保护人类基因组数据非常重要。精确逻辑回归是一种基于惩罚可能性的偏差减少方法,用于发现与疾病易感性相关的罕见变异。我们提出了HEALER框架,以促进小样本安全的罕见变异分析。结果:我们的目标是以降低计算和存储成本为目标的算法设计,以学习同态精确逻辑回归模型(即评估系数的P值),其中电路深度与数据大小的对数尺度成正比。我们使用罕见的川崎病数据集评估算法性能。可用性和实施:下载HEALERhttp://research.ucsd-dbmi.org/HEALER网站/
主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/32/2/211/1744166
相关软件: HEAN公司;FHEW公司;NTRU公司;HElib(HElib)
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