MDSimAid公司 swMATH ID: 30363 软件作者： 克罗克，M。；南卡罗来纳州汉普顿。；Matthey，T。；J·伊扎盖尔。 描述： MDSIMAID：快速静电算法中的自动参数优化。MDSIMAID是一个推荐系统，它优化了并行粒子网格Ewald（PME）以及顺序和并行多重网格（MG）求和快速静电解算器。MDSIMAID在给定的容错范围内优化了这些方法的运行时间或并行可伸缩性。MDSIMAID从半经验性能模型开始，对每个方法的参数空间执行运行时约束搜索。向用户提供建议的参数。MDSIMAID对MG的优化导致配置比发布的建议快14倍或准确17倍。优化PME可以提高其并行可伸缩性，使其在我们的测试中并行运行的速度提高一倍。MDSIMAID及其Python源代码可以通过位于以下位置的Web门户访问：http://mdsimaid.cse.nd.edu。 主页： http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download？doi=10.1.1.1.9146&rep=rep1&type=pdf 依赖项： 蟒蛇 相关软件： NAMD公司;FFTW公司;格鲁马克斯;琥珀色;Matlab公司 引用于： 1文件 2位作者引用 1 Lindbo，达格 1 安娜·卡琳·托恩伯格 连载1篇 1 计算物理杂志 在2个字段中引用 1 数值分析（65-XX） 1 光学、电磁理论（78-XX） 按年份列出的引文