SNPs3D swMATH编号: 30035 软件作者: P.Yue、E.Melamud、J.Moult 描述: SNPs3D:关联研究的候选基因和SNP选择。背景:疾病易感性和遗传变异之间的关系是复杂的,许多不同类型的数据都是相关的。我们描述了一个网络资源和数据库,它在分子水平上提供并整合了尽可能多的关于疾病/基因关系的信息。描述:资源网址:http://www.SNPs3D.org有三个主要模块。一个模块确定哪些基因与特定疾病有关。第二个模块提供关于候选基因集之间关系的信息。第三个模块分析非同义SNP对蛋白质功能的可能影响。疾病/候选基因关系和基因-基因关系是通过简单但有效的文本分析从文献中得出的。SNP/蛋白质功能关系由两种方法导出,一种使用蛋白质结构和稳定性原理,另一种基于序列保守性。每个基因的条目都包含许多指向其他数据的链接,例如表达谱、路径上下文、小鼠淘汰信息和论文。基因相互作用以交互式图形界面呈现,提供对潜在信息的快速访问,以及通过网络的方便导航。资源的使用通过炎症反应和高血压方面进行了说明。结论:SNP影响分析、基于知识的基因关系和候选基因网络,以及对广泛数据和文献的访问,使用户能够快速吸收可用信息,从而开发基因-途径-疾病相互作用的模型。 主页: https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-7-166 相关软件: PMut(PMut);nsSNP分析仪;自动静音;四-2L;Qhull公司;GPCR-GIA公司;UniProt公司;位置传感器;标准SNP;药学GKB;SNP效果;药芯PPI;线圈检查;折叠X;PoPMuSiC公司;CUPSAT公司;MCCE2公司;查姆;格鲁马克斯;TINKER公司 引用于: 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 埃米尔·阿列克索夫 1 马吉德·马索 1 玛丽亚·米提娃。 1 维斯曼,Iosif I。 1 王,林 1 张哲 2篇连载文章中引用 1 医学中的计算和数学方法 1 理论生物学杂志 在3个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 统计学(62-XX) 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文