GlobalAncova公司 swMATH ID: 30019 软件作者: U.Mansmann、R.Meister、M.Hummel、R.Scheufele、S.Knueppel 描述: 生物导体/R包GlobalAncova:通过模型比较对变量组进行全球测试。通过全局F检验测试感兴趣的变量(如两组)和一组变量(如基因集)的全局模式之间的关联。我们给出了以下支持GlobalAncova方法的论据:经过适当的归一化,基因表达数据看起来相当对称,离群值不是真正的问题,因此最小二乘法应该相当稳健。具有交互作用的协方差分析产生饱和数据建模,例如每个组和基因的不同平均值。协变量调整有助于纠正可能的选择偏差。方差同质性和不相关残差是不可预期的。普通最小二乘法的应用给出了无偏的,但不再是最优估计(Gauss-Markov-Aitken)。因此,由于相关性,使用经典的F检验是不合适的。然而,测试统计反映了与零假设的偏差。结合排列法,可以近似得出经验显著性水平。或者,近似值产生渐近p值。该框架通过似然比方法推广到分类变量组甚至混合数据。支持封闭的分层测试程序。这项工作得到了NGFN拨款01 GR 0459、德国BMBF和德国BMBF-拨款01ZX1309B的支持。 主页: https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GlobalAncova.html 依赖项: 对 相关软件: 对;利马;GSA公司;全球气候变化评估;生物导体;石墨;KEGG公司;gR基础;平静的;加迈尔;模拟序列;Voom公司;随机森林;ProbCD(问题CD);第PAGE页;GOTM公司;有形的;limmaGUI公司 引用于: 5文件 全部的 前5名13位作者引用 1 活页夹,哈拉尔德 1 莫妮卡·基奥尼亚 1 Andrew J.Dannenberg。 1 维拉Djordjilović 1 李伟明 1 梁坤 1 刘菲 1 克莉丝汀·波泽利乌斯 1 维罗尼卡·赖塞 1 马丁·舒马赫 1 苏珊娜·斯坦普夫 1 熊晓歌 1 周希凯西 4篇连载文章中引用 2 应用统计学年鉴 1 多元分析杂志 1 统计规划与推理杂志 1 计算统计学 在3个字段中引用 5 统计学(62-XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 数值分析(65-XX) 按年份列出的引文